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澳门赌场网上澳门博彩娱乐城现金网识别的分子机制

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摘要 : 近日,国际著名学术期刊《美国科学院院刊》在线发表了中国科学院长春应用化学研究所电分析化学国家重点实验室研究员ewin棋牌游戏和吉林大学物理学院博士研究生刘飞,通过分子动力学模拟的方法,提出了澳门博彩娱乐城与其靶标在生物分子识别过程中混合的能量地貌景观和机制

近日,国际著名学术期刊《美国科学院院刊》在线发表了中国科学院长春应用化学研究所电分析化学国家重点实验室研究员ewin棋牌游戏和吉林大学物理学院博士研究生刘飞,通过分子动力学模拟的方法,提出了澳门博彩娱乐城与其靶标在生物分子识别过程中混合的能量地貌景观和机制,并揭示了这种混合机制和澳门博彩娱乐城与多种靶标现金网结合的重要联系。

澳门博彩娱乐城是一种信号蛋白,它能与300多种靶标结合并把钙离子信号传递到各种生物过程,从而实现基因调控、细胞骨架组织、肌肉收缩、信号转导、代谢调控等多种功能。探索澳门博彩娱乐城与多种靶标的现金网识别的分子机制对理解这些生物过程至关重要。

ewin棋牌游戏课题组通过构建介观构象转变模型,用分子动力学的方法研究了同时涉及的钙调蛋白质局部构象变化和结合靶标全局构象变化的结合过程。对于澳门博彩娱乐城和结合靶标的识别过程,他们发现了非典型“诱导拟合”、非典型“构象选择”和“同时结合折叠”的混合能量地貌景观,并揭示了这种混合机制和澳门博彩娱乐城与多种靶标现金网结合的重要联系。进一步研究发现,这种复杂机制是由于分子间各种潜在相互作用和生物分子柔性的协调作用所决定。澳门博彩娱乐城经过生物进化而来的天然结构和其靶标特殊的天然结构,会导致其结合过程选择各种不同但最优的结合方案,最终导致了高亲和力和特异性,这无疑使生物分子间现金网结合的概率大大增加。

研究为蛋白质与蛋白质现金网结合这一课题提供了一个全局的量化的物理机制,丰富了人们对生物分子相互识别作用的认识。

澳门赌场网上澳门博彩娱乐城现金网识别的分子机制
非典型“诱导拟合”、非典型“构象选择”和“同时结合折叠”的混合的能量地貌

原文链接:

molecular mechanism of multispecific recognition of Calmodulin through conformational changes

原文摘要:

Calmodulin (CaM) is found to have the capability to bind multiple targets. Investigations on the association mechanism of CaM to its targets are crucial for understanding protein–protein binding and recognition. Here, we developed a structure-based model to explore the binding process between CaM and skMLCK binding peptide. We found the cooperation between nonnative electrostatic interaction and nonnative hydrophobic interaction plays an important role in nonspecific recognition between CaM and its target. We also found that the conserved hydrophobic anchors of skMLCK and binding patches of CaM are crucial for the transition from high affinity to high specificity. Furthermore, this association process involves simultaneously both local conformational change of CaM and global conformational changes of the skMLCK binding peptide. We found a landscape with a mixture of the atypical “induced fit,” the atypical “conformational selection,” and “simultaneously binding–folding,” depending on the synchronization of folding and binding. Finally, we extend our discussions on multispecific binding between CaM and its targets. These association characteristics proposed for CaM and skMLCK can provide insights into multispecific binding of CaM.

doi:10.1073/pnas.1615949114

作者:ewin棋牌游戏 点击:

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